El CIREN cuenta con un Servicio de Neurocirugía vinculado al Programa de Restauración Neurológica que ofrece sus servicios a las cinco clínicas, donde se aplican neurocirugías especializadas de acuerdo a las enfermedades del sistema nervioso que se tratan en ellas. Con un novedoso enfoque denominado "cirugía neuro-restauradora del Sistema Nervioso Central" basado en métodos quirúrgicos de mínimo acceso por Técnicas Estereotácticas con planeamiento automatizado y comprobación neurofisiológica por semi-micro-registros de la actividad neuronal Este servicio brinda varias opciones de tratamiento a diversas enfermedades craneales y espinales, donde además de emplearse los clásicos abordajes convencionales, se aplican las bondades de la cirugía guiada por imágenes. Es de destacar, el alto desarrollo alcanzado en el diseño e implementación de programas de localización, que permite la realización, con un alto grado de precisión, de cirugías funcionales, tumorales y vasculares. La introducción paulatina de los abordajes a la base del cráneo nos ha permitido ir incorporando nuevas opciones para pacientes con lesiones de gran complejidad y difícil localización, al igual que el progresivo desarrollo de modalidades quirúrgicas para pacientes con epilepsia del lóbulo temporal.

Aunque se llevan algunos años realizando cirugías de epilepsias refractarias, se considera entre los métodos más novedosos que hoy desarrolla el Servicio por la importancia que tiene en la mejoría de la calidad de vida de los pacientes y los magníficos resultados alcanzados en esta línea, teniendo en cuenta que la epilepsia crónica intratable por medicación antiepiléptica, conlleva un pobre pronóstico, con una elevada tasa de mortalidad que se incrementa con la edad.

Las principales líneas de trabajo de nuestro servicio incluyen:
- Cirugía Funcional Estereotáxica (Enfermedad de Parkinson, Distonías, Temblor esencial).
- Cirugía Funcional Estereotáxica de la Epilepsia Refractaria del lóbulo temporal.
- Diagnóstico y tratamiento quirúrgico de tumores cerebrales y de la médula espinal.
- Neurocirugía Vascular.
- Neuroendoscopías.
- Cirugía de la Base de Cráneo

Una nueva línea de trabajo se brinda en coordinación con la Clínica de Lesiones Raquimedulares que es el SERVICIO DEL TRATAMIENTO DEL DOLOR RAQUÍDEO donde se dispone de herramientas adicionales que nos permiten dar solución a través de un equipo multidisciplinario a problemas relacionados con el dolor, principalmente neurológico, y consta de tratamientos mínimamente invasivos para el alivio y curación de disímiles dolencias mediante la profundización en el diagnóstico y conducción del tratamiento de un gran número de afecciones neuropáticas centrales y periféricas no quirúrgicas, así como trastornos degenerativos o traumáticos del neuroeje con criterios quirúrgicos o no, para las que proponemos un tratamiento integral.

La experiencia neuroquirúrgica y de diseño de softwares especializados en la aplicación de técnicas estereotácticas del Centro Internacional de Restauración Neurológica , unido al desarrollo alcanzado por los especialistas del Centro de Inmunoensayo CIE en la construcción de instrumentos mecánicos de alta complejidad y precisión; ha permitido diseñar y crear el Sistema Estereotáxico "Estereoflex" que es un sistema concebido para la realización de procedimientos con marco, combinando para esto la simplicidad, exactitud y versatilidad de sus aplicaciones.